O Departamento de Zoologia está localizado dentro do centro de biociências, tendo sua secretaria localizada no primeiro andar do Centro. Como o nome já diz, este departamento se dedica ao estudo dos animais, contando com 25 docentes que atuam em diversas lindas de pesquisa e que ministram aulas nos diversos cursos de saúde ligados ao centro, principalmente, para Ciências Ambientais e para o Bacharelado e a Licenciatura em Ciências Biológicas.

Vinculado ao departamento e aos docentes, totalizam 21 laboratórios, localizados no prêdio do CB, em seu Anexo e no Laboratório central.