Roteiro do trabalho de Genética Molecular (1o. semestre de 2011) e Planilha de distribuição de sequências de DNA para o trabalho , valendo como a terceira nota da disciplina.
1. Roteiro
O trabalho deve seguir as diretrizes pertinentes a trabalhos científicos formais; deve conter uma capa, introdução, Metodologia, Resultados e Discussão (que podem ser juntos). Conclusões (que não deve ser um resumo dos resultados) e Referências (citadas no texto). Deve ser entregue impresso.
Cada aluno receberá (ver tabela abaixo) uma sequência para anotar (identificada pelo seu nr. de acesso). A partir disso algumas questões devem ser respondidas e algumas tarefas cumpridas, de acordo com o roteiro do Prof. Kido, adicionado de demandas do Prof. Paulo.
Qual o provável gene correspondente (similar) à sequência dada? Comente detalhadamente a página do gene homólogo (similar - não é a página do acesso)).
O CDS é completo? Qual a proteína correspondente? Comente detalhadamente a página da proteína.
Há UTRs na sequência dada?
Há introns no gene homólogo?
A sequência fornecida é sense ou anti-sense?
Faça dois dendrogramas a partir da sequência de CDS e da sequência da proteína equivalente e avalie qual dos dois representa de forma mais adequada a relação filogenética entre os organismos apresentados. Se necessário restrinja o conjunto de sequências apresentadas a grupos de organismos.
2. Planilha de Distribuição das sequências (acesso)
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Aluno |
Espécie solicitada |
Foi Substituida Por |
Acesso |
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Isabela Gonçalves |
Aedes aegypti |
FK669934.1 |
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Jéssica de Souza Brayner |
Aedes aegypti |
FK669925.1 |
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Débora Lubambo de Melo |
Aedes aegypti |
FK669931.1 |
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Helena Soares Barros de Oliveira |
Agaricia fragilis |
CS079485.1 |
|
|
Lise de Paula |
Aspergillus flavus |
CO152653.1 |
|
|
Ana Elisabeth Cordeiro Sayegh |
Balaenoptera physalus |
Eubalaena glacialis |
ES588265.2 |
|
Igor de Farias Domingos |
Candida albicans |
AF405230.1 |
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|
Hellen Germano da Silva |
Canis lupus familiares |
DN383754.1 |
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|
Juliana Maria de Melo |
Cavia porcellus |
EL945648.1 |
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Juliana Vieira de Barros |
Chelonia mydas |
Trachemys scripta |
FG341039.1 |
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Leonardo de Melo Carneiro |
Didelphis albiventris |
Monodelphis domestica |
DR041731.1 |
|
Fernanda Ivo dos Santos |
Drosophila melanogaster |
GR705870.1 |
|
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Fernanda Y. Uchôa Okuyama |
Drosophila melanogaster |
GR705869.1 |
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|
Italo José Batista Daniel |
Drosophila willistoni |
EB502892.1 |
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|
Flávia Roberta Santos Andrade |
Epinephelus lanceolatus |
Epinephelus coioides |
BQ096573.1 |
|
Gabrielle Lott |
Escherichia coli |
Salmonella enterica |
GO344420.1 |
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Joana Suassuna N. Veras |
Escherichia coli K-12 cspG |
Edwardsiella ictaluri |
GR487969.1 |
|
Júlio Lustoso Araújo |
Galeocerdo cuvier |
Scyliorhinus canicula |
FP885736.1 |
|
Nara Barbosa Araújo |
Homo sapiens sapiens |
M61970.1 |
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|
José Breno Macário |
Homo sapiens sapiens |
EL952001.1 |
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Luana Santos de Santana |
Jatropha curcas |
GW881656.1 |
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|
Hans Christopher Saegesser Santos |
Leishmania chagasi |
CV670723.1 |
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Lydia Mesquita V. de Barros Neta |
Mus musculus |
AB575976.1 |
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Leonardo Dornelles |
Nasutitermes corniger |
Coptotermes formosanus |
FK833516.1 |
|
Vanessa Campelo Souza |
Pan troglodytes verus |
DC529635.1 |
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|
Raissa Marques Mendonça |
Rattus norvegicus |
FQ239542.1 |
|
|
Ana Corolina Liberal |
Rattus norvegicus |
FQ239561.1 |
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|
Wialla Karmen T. de Farias |
Rhincodon typus |
Ginglymostoma cirratum |
AY168631.1 |
|
Renata Vaz Uribinati |
Tityus serrulatus |
Mesobuthus gibbosus |
CB334108.2 |
|
José Brayner Júnior |
Tityus stigmurus / Tityus serrulatus |
Lychas mucronatus |
GT029271.1 |
|
Eric Bento Caldas |
Varíola Guarani P1 |
HQ402906.1 |
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|
Tatiane Alexandre de Araújo |
Wuchereria bancrofti |
AW755260.1 |