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Notícias para Técnicas Moleculares na Biologia - UFPE

 

09/11/2006 - Reduzidos a três alunos! Isto é o que dá botarem a disciplina pela manhã. Mas não é culpa dos responsáveis pela disciplina, esta foi uma decisão da coordenação de C. Biológicas.

Vamos ao que interessa: três eletroferogramas do ABI3400 (da Fiocruz) para análise. O programa Chromas Lite deve ser baixado do site daTechnelysium (http://www.technelysium.com.au/chromas_lite.html)

 

seq 2  - aprox. 250 kb - é uma sequência muito ruim

seq 1 e seq 3 - aprox. 250 kb - sequências de excelente qualidade. Observem a redução gradual do cavado entre os picos, à medida que a sequência avança.

 

________________________________________________________________(fim do 1o. semestre 2006)

 

03/10/2006 - Notas de Ludmilla (3,1) e Newton (6,1). Tabela abaixo corrigida.

 

03/10/2006 - Notas de Ludmilla (3,1) e Newton (6,1). Tabela abaixo corrigida.

 

29/09/2006 - Quem precisar estudar para a final, favor começar logo.

ALUNO
NOTA1
NOTA2
MÉDIA
SIT
Seminário
Andréa Carla Rodrigues Pereira 
F
F
-
RP
Betânia Lucena Tavares Borges Domingues
8,70
9,00
8,85
AP
Talassemia
Bruna Luna da Silva
6,50
9,00
7,75
AP
Hemocromatose
Carla Michella Leal Soares
4,80
10,00
7,40
AP
Ehrlichiose
Dewson Rocha Pereira
5,10
9,00
7,05
AP
Toxoplasmose
Diego Dias da Silva
4,40
10,00
7,20
AP
Hepatite C
Diego Sotero de Barros Pinangé
7,40
9,00
8,20
AP
Meningite
Diogo da Rocha Poroca
9,00
9,00
9,00
AP
Tuberculose
Diogo Castelo Branco Alves Torres
5,40
9,00
7,20
AP
Hemocromatose
Douglas Leonardo Leite da Fonseca
6,60
9,00
7,80
AP
Tuberculose
Fábio José Fidelis Almeida
3,10
9,50
6,30
FI
LMC
Flávia Roberta Barbosa de Araújo
7,60
10,00
8,80
AP
Ehrlichiose 
Geyner Alves dos Santos Cruz
7,70
9,50
8,60
AP
Malária
Heidi Lacerda Alves da Cruz
7,00
9,50
8,25
AP
Malária
Joel Henrique Teles dos Santos
6,40
9,50
7,95
AP
LMC
José Odinilson de Caldas Brandão
6,50
9,00
7,75
AP
Talassemia
Ludmila Mirelle Inácio da Silva
3,10
7,00
5,05
FI
aspergilose
Marina de Assis Souza
5,00
9,00
7,00
AP
Toxoplasmose
Marina Marcuschi
8,60
10,00
9,30
AP
Hepatite C
Monique Ferraz de Sá Beltrão
7,10
10,00
8,55
AP
HPV
Nathalia de Alencar Cunha Alves
6,20
10,00
8,10
AP
HPV
Newton Gil Peres
6,10
9,00
7,55
AP
Meningite
Renan Carlos da Silva
6,40
9,00
7,70
AP
Toxoplasmose
Sarah Pereira Rodrigues
5,40
7,00
6,20
FI
aspergilose
                  					

 

25/09/2006 - Notas da primeira prova (finalmente) - Alunos sem nota ou nome na lista devem fazer a segunda chamada quinta feira próxima. As notas dos seminários estarão no ar até quarta, 27, de manhã.

Nome Nota
Andréa Carla Rodrigues Pereira  
Betânia Lucena Tavares Borges Domingues 8,7
Bruna Luna da Silva 6,5
Carla Michella Leal Soares 4,8
Dewson Rocha Pereira 5,1
Diego Dias da Silva 4,4
Diego Sotero de Barros Pinangé 7,4
Diogo da Rocha Poroca 9,0
Diogo Castelo Branco Alves Torres 5,4
Douglas Leonardo Leite da Fonseca 6,6
Fábio José Fidelis Almeida 3,1
Flávia Roberta Barbosa de Araújo 7,6
Geyner Alves dos Santos Cruz 7,7
Heidi Lacerda Alves da Cruz 7,0
Joel Henrique Teles dos Santos 6,4
José Rodrigues Teles dos Santos  
José Odinilson de Caldas Brandão 6,5
Marina de Assis Souza 5,0
Marina Marcuschi 8,6
Monique Ferraz de Sã Beltrão 7,1
Nathalia de Alencar Cunha Alves 6,2
Renan Carlos da Silva 6,4
Sarah Pereira Rodrigues 5,4

                  

28/08/2006 (18:30) - 2 artigos de leucemia e dois de papiloma adicionados

 

21/08/2006 (13:00) - O artigo de malária está disponível (listão abaixo)

 

17/08/2006 (13:00) - 2 novos artigos enviados para os seminários, no quadro geral abaixo

 

16/08/2006 (13:00) - Mais artigos e textos enviados para os seminários, linkados abaixo

 

07/08/2006 (20:00) - Influenza foi trocada por Malária...

 

06/08/2006 (14:00) - Alguns artigos de apoio para download (clique com o botão direito do mouse para download)

Toxoplasmose 1 (95 kb)

Toxoplasmose 2 (1,4 Mb)

Tuberculose 1 (1,1 Mb)

Tuberculose 2 (2,3 Mb)

Ehrlichiose (1,0 Mb)

HCV-minireview (não serve como base de seminário) (81 kb)

HCV-1 (813 kb)

HCV-4 (76 kb)

Meningite 1 (82 kb)

Meningite 2 (84 kb)

Meningite 3 (82 kb)

Aspergiloses (120 kb)

Mycobaterium1 (120 kb)

Mycobaterium2 (227 kb)

Malária (1,49 Mb)

Leucemia 1 (373 kb)

Leucemia 2 (492 kb)

Papiloma 1 (253 kb)

Papiloma 2 (93 kb)

 

 

05/08/2006 (14:00) - Adição de mais um seminário. Ordem final:

Ordem dos seminários (dois por dia)

 

Toxoplasmose

Tuberculose

 

Meningite bacteriana

Ehrlichiose

Aspergiloses

 

Malária

Hepatite C

 

Clonagem e expressão do gene E6 de HPV

Alfa-talassemia

 

Hemocromatose hereditária

Leucemia mielóide crônica

 

 

 

 

04/08/2006 (20:00) - Novas instruções para os seminários e ordem das apresentações

 

a) na segunda parte da disciplina a presença é obrigatória: cada seminário não assistido descontará um ponto na nota de seminário do faltoso.

b) todos os seminários devem se encaixar no roteiro.

c) os coordenadores da disciplina querem de cada grupo um (apenas um) artigo ou texto de referência, que deve ser entregue no dia 10 de agosto ou enviado no formato pdf até o dia 09/08, às 18:00 h

d) deveremos ter uma segunda avaliação (segunda prova), que vai se somar à nota do seminário. Não decidimos ainda de que forma esta soma será feita. se média simples ou ponderada. A segunda avaliação incluirá perguntas sobre todos os seminários.

 

Ordem dos seminários (dois por dia)

 

Toxoplasmose

Tuberculose

 

Meningite bacteriana

Aspergiloses

 

Malária

Hepatite C

 

Clonagem e expressão do gene E6 de HPV

Alfa-talassemia

 

Hemocromatose hereditária

Leucemia mielóide crônica

 

 

 

04/08/2006 (16:30) - Começam a aparecer os temas e grupos, mas faltam algumas informações (e-mails dos participantes). E, de qualquer forma, tem que haver um ajuste da apresentação para o roteiro linkado abaixo: quem quiser aproveitar o que está fazendo como estágio, trate de se ajustar ao roteiro também.

1. Clonagem e expressão do gene E6 do HPV (tipo 16) - Monique Ferraz de Sa Beltrão (Biomedicina) e  Nathalia de Alencar Cunha Tavares (Biomedicina)

2. Malária - Heidi Lacerda Alves da Cruz (C.Biológicas/Bacharelado) e Geyner Alves dos Santos Cruz (C.Biológicas/Bacharelado)

3. Tuberculose - Diogo da Roca Poroca e Douglas Leonardo Leite da Fonseca

4. Leucemia Mielóide Crônica - LMC - Fábio José Fidélis Almeida (Biomedicina) e Joel Henrique Teles dos Santos (Biomedicina)

5. O Uso de Técnicas Moleculares no Diagnostico da Hepatite C - Diego Dias da Silva e Marina Marcuschi

6. Toxoplasmose - Dewson Rocha Pereira, Marina de Assis Souza e Renan Carlos da Silva

7. Diagnóstico molecular de aspergiloses - Sarah Pereira Rodrigues e Ludmila Mirelle

8. Meningite Bacteriana - Diego Sotero de Barros Pinangé (C. Biológicas/Bacharelado) e Newton Gil Peres - Biomedicina

9. Alfa-talassemia - Betânia Lucena T. B. Domingues e José Odinilson de Caldas Brandão

10. Pesquisa da mutação da Hemocromatose Hereditária - Diogo Castelo Branco Alves Torres e  Bruna Luna da Silva

11. Diagnóstico molecular da ehrlichiose canina - Flávia Roberta Barbosa de Araújo e Carla Michella Leal Soares

e-mails da turma (o)

 

03/08/2006 - Roteiro para elaboração dos seminários; é uma sugestão, mas os pontos enfatizados têm que ser abordados. Até amanhã (sexta feira) às 17:00 horas aguardaremos as propostas de seminários e de componentes dos grupos (por favor, enviem nomes completos de cada participante e seus e-mails respectivos). Os que não enviarem (para andrade@ufpe.br, com cópia para ederson.kido@gmail.com, não esquecer!) serão contemplados com seminários escolhidos pela coordenação da disciplina. A Coordenação responderá com um "recebido" as propostas. Quem não receber nada até às 16:30 de amanhã (sexta) deve re-enviar a proposta. A ordem dos seminários será estabelecida pela Coordenação.

 

Até agora não temos notícia oficial de nenhum seminário definido, apenas sugestões. Não se esqueçam dos nomes completos e e-mails de cada participante.

 

03/08/2006 - Link para o texto da primeira avaliação de TMB

 

25/07/2006 - alunos sem curso... por favor verifiquem a tabela e me informem pelo e-mail

 

19/07/2006 - Nem tudo pode ser genética: anexo para os curiosos e amantes de música uns bregazinhos light, produzidos provavelmente lá prás bandas da Guiana Francesa, mas que são cantados numa língua híbrida (desafio: tentar entender).

Baixem aqui: lambada1; lambada2, lambada3, lambada4 (tamanhos: 3,7 Mb a 5,1 Mb) e boa diversão..

 

mas algo deve ser genética...: a aula 4 (início do data-mining) está no ar.

 

28/06/2006 - Adicionado um Programa tentativo para a disciplina e algumas pequenas alterações na página inicial de aulas,

 

23/06/2006 - Andamento da disciplina: como se pode ver pelo cronograma proposto, estamos com um "descompasso" no conteúdo programático. Isso tem que ser resolvido nas próximas aulas. Assim, os professores da disciplina sugerem muita leitura do conteúdo das aulas 1 a 5 (Genética Molecular - CCB) antes de serem ministradas: quem vê duas vezes vê melhor...

 

 

22/06/2006 - Até agora os inscritos oficialmente na disciplina são:

 

Nome Curso
Andréa Carla Rodrigues Pereira  
Betânia Lucena Tavares Borges Domingues Biomedicina
Bruna Luna da Silva Biomedicina
Carla Michella Leal Soares Biomedicina
Dewson Rocha Pereira Biomedicina
Diego Dias da Silva  
Diogo Castelo Branco Alves Torres Biomedicina
Douglas Bayer Vieira  
Fábio José Fidelis Almeida  
Flávia Roberta Barbosa de Araújo Biomedicina
Geyner Alves dos Santos Cruz  
Heidi Lacerda Alves da Cruz  
Joel Henrique Teles dos Santos Biomedicina
José Rodrigues Teles dos Santos  
José Odinilson de Caldas Brandão  
Marina de Assis Souza Biomedicina
Marina Marcuschi C. Biol.
Monique Ferraz de Sã Beltrão  
Nathalia de Alencar Cunha Alves Biomedicina
Renan Carlos da Silva Biomedicina

 

Há pelo menos dois inscritos ainda não confirmados (só depois do dia 3/07):  Sarah Pereira Rodrigues e Diego Sotero de Barros Pinangé.  Negociamos com a Coordenação do Curso de C. Biológicas (ao qual está ligada a disciplina) 15 vagas para C. Biol. (Bach), 10 para C. Biom., 5 para C. Biol. (Lic) e 5 para C. Amb.. Divulguem entre os colegas!

 

A disciplina tem 60 horas e deverá seguir o quadro mostrado abaixo.  O horário oferecido poderá ser alterado para melhor convir aos alunos e professores da disciplina, sendo prevista a re-abertura de vagas e confirmação do novo horário no período para correção de matrícula (veja Calendário 2006 da Proacad)

 

DATA

Aula

DESCRIÇÃO

22/06

1

Técnica de PCR

Desenho de primers

29/06

2

Técnicas de obtenção de Marcadores moleculares

RFLP, RAPD, SSR, AFLP

06/07

3

Clonagem gênica –

Prática: clonagem virtual com pDraw32

13/07

4

Bionformática –  família BLAST; ORFINDER

20/07

5

Bionformática – alinhamento múltiplo com ClustalX

27/07

6

Técnica de DNA shuffling

03/08

 

Primeiro exercício

10/08

7

Técnicas de diagnóstico molecular de doenças virais

17/08

8

Técnicas de diagnóstico molecular de doenças bacterianas

24/08

9

Técnicas de diagnóstico molecular de doenças fúngicas

31/08

10

Técnicas de diagnóstico molecular de doenças por protozoários

14/09

11

Técnicas moleculares de sexagem

21/09

12

Técnicas moleculares na determinação de individualidade

28/09

 

segundo exercício

02/10*

 

Segunda chamada

11/10**

 

FINAL

* segunda-feira, ** quarta-feira (demais aulas: quinta-feira)

 

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